目前税制体系是以增值税为主体税种，实行以专用发票为主要扣税凭证的增值税征管制度。而“金税三期”就是在“以票控税”的指导思想下，建设的“究极形态”征管工具!对全国所有发票信息统一到“金三”系统中，通过大数据分析发票的轨迹监控所有企业的业务往来，防止不法分子利用虚开发票等手段进行偷逃国家税款的违法犯罪活动!
第一阶段：1994年，税务总局推行金税一期，包括增值税交叉稽核和增值税防伪税控两个子系统，在全国50个试点上线，通过人工采集纳税人的发票信息，再由计算机对比发现问题。但由于手工采集数据错误率太高，金税一期惨遭停用。
第二阶段：2001年，吸取一期教训，金税二期实现了发票数据的自动采集，于此同时增加税种，把海关增值税完税凭证纳入管理，并将上述功能推广至全国使用。
第三阶段：在经历了金税一期、二期(地税未完全覆盖)后，2013流程年，“金三”终于来了!经过在广东、山东、河南、山西、内蒙古、重庆6个省(市)级国地税局试点后，终于在2016年完成全部推广工作后开始实施。
二金三实现了国地税和其他部门的联网。
金税三期的总体目标为建立“一个平台、两级处理、三个覆盖、四个系统”。一个平台指包含网络硬件和基础软件的统一的技术基础平台。两级处理指依托统一的技术基础平台，逐步实现数据信息在总局和省局集中处理。三个覆盖指应用内容逐步覆盖所有税种，覆盖所有工作环节，覆盖国地税并与相关部门联网。四个系统指通过业务重组、优化和规范，逐步形成一个以征管业务系统为主，包括行政管理、外部信息和决策支持在内的四个应用系统软件。
金税三期的功能更加强大，运行更加顺畅，内容更加完备，流程更加合理。其中，最重要的就是实现国地税和其他部门的联网。简单来说，金税三期全国统一了税收征管及相关税务系统软件，不再是各省各自为政，减少数据利用的难度。
三税务局的大数据评估及云计算平台
1、企业的任何事项均会留下记录，金税三期的大数据，也会追踪企业的资金流、票据流等。只要大数据系统将企业纳税人识别号做为起点，追查同一税号下进项发票与销项发票，企业是否虚开发票了，以及是否购买假发票入账，其实一目了然。
2、开票软件已经增加了商品编码，为下一步企业开票的货物流监控预留接口，买黄金票冲进项的年代一去不复返。
3、五证合一后，税务、工商、社保、统计、银行等接口，个税社保、公积金、残保金、银行账户等，应该在税务系统里面一览无余!
4、金三上线后，企业的违规被查风险确实增大，掩耳盗铃式的反舞弊手段失灵，一批靠偷漏税的企业，要走向死亡内蒙。
四大数据上线大半年，已经很多企业栽了!
最近几次因为退税原因去税务局办事情发现，找专管员都需要排很长时间的队，很多企业都是被国税总局风险评估后识别出企业抵扣的进项税发票有问题，要求企业自查后跑去税务局进行增值税进项转出的。大数据上线后，被税务局预警后评估稽查的企业，结果是交回抵扣的税款，并受到漏缴税款0.5倍--5倍的罚款，还有每天万分之五的税收滞纳金!
现在金税三期大数据上线，税务局系统升级后只要动态数据比对不对，税负率偏低，系统会自动预警，税务局评估科的人员会马上打电话让拿三年的账交过去进行查账，后续的麻烦就不是当初抵扣的那点税款可以解决的。
五金税三期大数据监测异常
金税三期大数据会从如下几个维度进行检验并判断出异常 ：企业的收入、成本、利润、库存、银行账户和应纳税额等。流程
1、企业的收入
如果你的企业少记了销售收入或是隐匿了一部分销售报税收入。那么金税三期可通过你的成本和费用来比对你的利润是否为负数，或是比对你开具出去的发票，收到的货款数额以及卖出的商品，或者进一步通过大数据，查询与你交易的下游企业的相关账本数据，比对出异常。
2、企业的成本费用
如果你的企业长期购进原材料或商品时暂估入库、企业购进原材料或商品为了价格低一点而不索要发票、企业计提了费用而迟迟没有费用发票。那么金税三期会比对你的每一笔支出数额，相应的商品或服务以及对应的发票，三者应该是一一对应的，若少了任何一项，都会被判定为异常。
3、企业的利润
如果你的企业的利润表中的利润总额与企业所得税申报表中的利润总额不一致;如果你想“财不露白”，将利润少报一部分。如上所述，金税三期大数据是可以得到你所有的收入信息和成本信息的，而利润就是收入减去成本，你说它算出你的利润会是什么难事吗?所以若你的利润不一致还是少报了，都会被轻易查出来。
4、企业的库存
一般来说，企业都会有库存，包括原材料库存和成品或半成品库存。而且库存量一般都在一个相对稳定的指附近呈周期性波动。
金税三期大数据会先判断出的库存是否一直处于递减或递减状态，并进一步形成电子底账来比对你的库存，最后判断出异常。
5、企业的银行账小规模户
如果你的企业销售了一批货物 ，货款也已进入到银行账户，收到的货款却迟迟没小规模记入账中;
如果你的企业取得了一些虚开的发票，而账户里面的资金却没有减少或减少额不匹配。
对于这些情况，以前只要账本调整的好，是很难识别出来的，可现在对于上述包括以下情形，金税三期系统都会进行分析并识别出异常：
企业当期新增应收账款大于收入80%、应收账款长期为负数;
当期新增应付账款大于收入80%;
预收账款减少但未记入收入、预收账款占销售收入20%以上;
当期新增其他应收款大于销售收入80%。
6、企业的应纳税额
如果你的企业增值税额与企业毛利不匹配;
如果你的企业期末存货与留底税金不匹配;
如果你的企业缴纳了地税附加税费，但与国税增值税比对不一致;
如果你的企业实收资本增资了，而印花税却为0;
如果你的企业增值税额偏低;
如果你的企业所得税贡献率长期偏低;如果你的企业应纳税额变动太大。
那么金税三期都会识别出来的。前四个维度都能识别出异常，而应纳税额就是有以上的数据为基础计算出来的，所以金税三期通过比对你的收入、成本、利润、库存、资产资本、国地税数据、往期税收数据等来判定出企业应纳税额的异常。
其实企业只要行的端坐的正，真实的、准确的、合法的经营、开具取得发票和做账并按时按规申报，即使是被金税三期查出所谓的异常也是不用担心的，毕竟它查出异常只是第一步，还会有专门的人员具体的来核实，不会那么草率就判定你申报的数据作假，所以无需太过担心。
金税三期纳税人网上报税系统：总局金三网报系统依托“国家税务总局网上办税服务厅”网站实现，将分期实现税务登记、申报征收、发票管理、税收认定、税收证明、税收优惠、征纳互动等服务功能，第一期主要实现【申报征收】功能。
一、纳税人计算机一般准备
纳税人计算机需安装IE6.0或以上版本浏览器。
二、网上报税具体操作步骤
总局金三网报系统依托“国家税务总局网上办税服务厅”网站实现，将分期实现税务登记、申报征收、发票管理、税收认定、税收证明、税收优惠、征纳互动等服务功能，第一期主要实现【申报征收】功能。
(一)纳税人总局金三网报系统登录地址
直接在浏览器地址栏输入http://www.12366.cn进入。
(二)开始使用
1、纳税人登录
以单位纳税人为例，登录账号主用户为“纳税识别号”，子用户为“纳税人识别号_001—00N”。初始登录密码由地税机关设置并告知。登录后纳税人可以自一般行修改密码或通过子用户管理中的密码重置，由系统重新生成密码。
在左上侧登录框处，依次输入【账号】、【密码】和【验证码】，点击【登录】按钮进入系统。
2、控件下载
纳税人第一次登录网上办税服务厅时，系统强制弹出《新用户第一次使用指引》，阅读相关介绍后，在“系统运行环境设置—点击此处下载安装程序”处，下载“网上办税服务厅一键设置工具1.0”纳税人到本地计算机，解压后双击完成安装，先后点击【是】、【安装】两个按钮自动完成设置安装。
纳税人也可到“办税服务—下载专区—办税软件”，下载“网上办税服务厅一键设置工具1.0”。
3、子用户管理
大的企业或企业集团，需要使用多个用户办理网上报税时，纳税人可以设置多个子用户，但只能有一个主用户，税务机关为纳税人限定子用户数量上限。
纳税人使用主用户登录后，点击【子用户内蒙管理】按钮，进入子用户管理模块后，点击【增加】按钮，进入子用户增加页面，输入相关信息后，【用户所属角色】三个选项请全部选择。点【保存】按钮，保存子用户信息。主用户可对子用户完成启用、禁用、重置密码、修改信息等操作。
(三)操作说明
1、纳税申报
网上申报：将鼠标移动到【申报征收模块】后，系统根据税种核定情况自动出现相应的申报表，土地使用税、房产税、车船税申报的前提条件是必须先在主管税务机关办税服务厅申报登记税源信息。扣缴个人所得税申报的前提条件是主管税务机关办税服务厅已经维护个人所得税扣缴登记，可以通过网页版或客户端两种方式进行网上申报。建议明细申报数据超过100条的扣缴单位使用客户端软件;明细申报数据100条以下的通过网页版直接填写扣缴模板进行申报,扣缴模板通过网上申报平台下载。
纳税人每个申报表均需按照“初始化—填写申请表—确认申报表—查看回执”的顺序进行申报。
纳税人实行按期(月、季度、半年、年)申报的，申报期内每个税种只能在网上申报一次，少申报的需要到办税服务厅，由工作人员通过“申报错误更正”办理补充申报。
申报表作废：纳税人申报确认后，在划款前发现申报错误，可以作废相关申报表。申报表作废共分四步进行：查询申报信息—作废申请—确认作废—查看回执。
申报表作废只允许作废最近2天的申报税报数据且只能逐条作废，超过2天的，须到地税机关办税服务厅办理作废;纳税人申报错误但已经扣款成功，造成多缴税款的，须到地税机关办税服务厅申请办理退税或抵税。
2、财务报表申报
共分四步进行：初始化—填写申报表—确认申报表—查看回执。
第一步:初始化。进入【申报征收】—【资料报送与信息采集】—【财务报表报送与信息采集】后，出现初始化的页面后，确定【报送属期】、【报送期限】和【资料报送类型】后，点击【填写申报表】按钮，进入填写申报表页面
第二步：填写申报表。依次输入相关财务报表的数据后，点击【申报】按钮进入【申报确认】页面。
第三步：确认申报表。进入申报确认页面后，确认申报数据无误后，点击【确认】按钮，确认申报信息后，进入【查看回执】页面。
第四步：查看回执。进入查看回执2019页面后，打印回执和相关财务报表，用于向税务机关报送。
3、税(费)缴款
共分三步进行：缴款选择—缴款确认—缴款回执。
第一步：缴款选择。纳税人所有税费申报完毕后，进入【申报征收】—【税(费)缴款】—【征收缴款】模块，选择缴款方式为“实时扣款”，点击【确定】”按钮，自动进入【缴款确认】页面。
第二步：缴款确认。选择要扣款的税种后，点击【缴款】按钮，自动进入【缴款确认】页面，核对要扣款的2019信息与申报数据一致后，点击【确认】按钮进行划款，点击【确认】按钮，自动进入【缴款回执】
第三步：缴款回执。进入【缴款回执】页面后，打印或导出缴款回执和缴款信息。
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