一、增值税留抵的产生原因
根据《增值税暂行条例》第五条规定，一般纳税人销售货物或者提供应税劳务，应纳税额为当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。应纳税额计算公式：
应纳税额=当期销项税额-当期进项税额
当期销项税额小于当期进项税额不足抵扣时，其不足部分可以结转下期继续抵扣。
销项税额=销售额×税率
进项税额：纳税人购进货物或者接受应税劳务支付或者负担的增值税额。
留抵税额主要是纳税人进项税额和销项税额在时间上不一致造成的，如年末集中采购原材料和存货备货，形成较大的进项税；企业成立初期，购置房屋、设备等固定资产产生大量进项税，而初期收入，销项税较少，形成留抵税额。
二、增值税留抵退税之前的规定和处理
（一）注销时不退税
根据《国家税务总局关于企业破产、倒闭、解散、停业后增值税留抵税额处理问题的批复》（国税函[1998]429号），纳税人破产、倒闭、解散、停业后，其期初存货中尚未抵扣的已征税款，以及征税后出现的进项税额大于销项税额后不足抵扣部分(即留抵税额)，税务机关不再退税。《财政部 国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税[2005]165号）第六条规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。”即注销时，留抵退税不予以退税。
（2）留抵抵欠——抵减增值税欠税
留抵的增值税还有一个作用就是留抵抵欠，《国家税务总局关于关于增值税一般纳税人用进项留抵税额抵减增值税欠税问题的通知》（国税发 [2004]112号）规定，对纳税人因销项税额小于进项税额而产生期末留抵税额的，应以期末留抵税额抵减增值税欠税。
（3）个案中抵销欠税扩大解释
四川省遂宁市中级人民法院于2018年12月28日做出的（2018）川09民终1325号民事判决书，盛马公司欠缴消费税、企业所得税、房产税、土地使用税等各种税款329257062.97元，滞纳金334030264.27元，盛马公司在税务机关留抵增值税款86860689.92元，故盛马公司在税务机关留抵增值税款86860689.92元可以抵减其欠缴的税款。由于该判决作出之时，我国上尚无留抵退税的政策，笔者认为破产企业留抵的增值税根据规定只能抵减欠缴的增值税，不能扩大解释为所有税收。
三、留抵退税政策优惠
2019年以来，我国逐步建立了增值税增量留抵退税制度。留抵退税就是把增值税期末未抵扣完的税额退还给纳税人。
《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）第八条规定，自2019年4月1日起，试行增值税期末留抵税额退税制度。
之后又发布《财政部 税务总局关于明确部分先进制造业增值税期末留抵退税政策的公告》(财政部 税务总局公告2019年第84号)、《财政部 税务总局关于明确国有农用地出租等增值税政策的公告》(财政部 税务总局公告2020年第2号)第六条、《财政部 税务总局关于明确先进制造业增值税期末留抵退税政策的公告》(财政部 税务总局公告2021年第15号)几个政策，进一步深化了留抵退税。此三个，2022年4月1日起废止。
《财政部 税务总局关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》（财政部税务总局公告2022年第14号），加大小微企业以及“制造业”“科学研究和技术服务业”“电力、热力、燃气及水生产和供应业”“软件和信息技术服务业”“生态保护和环境治理业”和“交通运输、仓储和邮政业”的留抵退税力度，将先进制造业按月全额退还增值税增量留抵税额政策范围扩大至小微企业和制造业等行业，并一次性退还其存量留抵税额。
四、如何检查企业留抵税额
1、查询增值税纳税申报表，查看是否“期末留抵税额”有无数据。
2、导出财务账套，检查应交税费相关明细账。留抵增值税不是增值税科目“待抵扣进项税额”，留抵税额是指可抵扣的进项税大于销项税的差额，而“待抵扣进项税额”是指已认证但要以后期间才能抵扣的进项税。有些学者将留抵税额理解会计上的“待抵扣进项税额”是不对的。同样还有“待认证进项税”，是指未认证的进项税额。
3、获取财务审计报告，执行企业会计准则的企业，留抵税额在资产负债表中的“其他流动资产” 或“其他非流动资产”项目列示。
五、留抵退税与破产抵消
《税收征收管理法实施细则》第七十九条，当纳税人既有应退税款又有欠缴税款的，税务机关可以将应退税款和利息先抵扣欠缴税款;抵扣后有余额的，退还纳税人。这是税法上的“以退抵欠制度”。《企业破产法》第四十条规定，债权人在破产申请受理前对债务人负有债务的，可以向管理人主张抵销。即破产法上的“破产抵销制度”
在破产实务中，可以采取如下方式，将留抵税额变现成货币形式的可分配破产财产。
1、在申报债权时，抵销债务人欠缴的其他税款。
2、由主管税务机关退回，作为破产财产进行分配。
3、抵减处置其他破产财产应缴交的税款。管理人处置破产企业的其他实物财产涉及应缴纳税款（包括增值税销项税额），此时，可抵减销项税。
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