在海南自由贸易港的政策制度体系中，特殊的税收制度被赋予了更重要的地位。
中共中央、国务院印发了《海南自由贸易港建设总体方案》（下称《总体方案》），《总体方案》明确提出，以特殊的税收制度安排、高效的社会治理体系和完备的法治体系为保障，在明确分工和机制措施、守住不发生系统性风险底线的前提下，构建海南自由贸易启示港政策制度体系。
“海南自由贸易港的开放力度，超出了预期。”上海财经大学教授胡怡建说，在当前一些逆全球化声音中，中国要进一步加大全球化的进程。尤其是要以特殊的税收制度来加大中国开放力度，提升竞争力。
华中科技大学教授、光谷自贸研究院院长陈波也认为，这是中国对外开放的一个里程碑，提出了一些实质性的开放突破。
启示以零关税为基本特征
与海南自由贸易港提出的“特殊的税收制度安排”，包括了零关税、低税率、简税制，并要求按照海南自由贸易自由贸易港建设的不同阶段，分步骤实施，最终形成具有国际竞争力的税收制度。
其中，对于货物贸易，海南自由贸易港实行以“零关税”为基本特征的自由化便利化制度安排。
进口关税是指进口商品进入一国关境或从自由港、出口加工区、保税仓库进入国内市场时，由该国海关根据海关税则对本国进口商所征收的一种关税。近年来，中国已连续多次降低部分商品进口关税，2018港年11月1日起，我国关税总水平降至7.5%。
除了法定关税减免外，我国对关境内特定区域、特的定行业或者有特定用途的进出口货物减免关税。比如，在海关特殊监管区域内，境外货物入区实行保税或免税。
海南自由贸易港实行的零关税，是全岛封关运作前，对部分进口商品，免征进口关税、进口环节增值税和消费税。全岛封关运作、简并税制后，对进口征税商品目录以外、允许海南自由贸易港进口的商品，免征进口关税。
更进一步，《总体方案》明确了零关税的范围：除法律法规和相关规定明确不予免税、国家规定禁止进口的商品外，对企业进口自用的生产设备，实行“零关税”负面清单管理；对岛内进口用于交通运输、旅游业的船舶、航空器等营运用交通工海南具港及游艇，实行“零关税”正面清单管理；对岛内进口用于生产自用或以“两头在外”模式进行生产加工活动（或服务贸易过程中）所消耗的原辅料，实行“零关税”正面清单管理；对岛内居民消费的进境商品，实行正面清单管理，允许岛内免税购买。对实行“零关税”清单管理的货物及物品，免征进口关税、进口环节增值税和消费税。
而且，清单内容并非固定不变，《总体方案》提出，由有关部门根据海南实际需要和监管条件进行动态调整。
相对于其他海关特殊监管区，胡怡建说，海南自由贸易港的零关税范围更扩大了，比如，对岛内居民消费的进境商品，实行正面清单管理，允许岛内免税购买。
陈波也表示，海关特殊监管区内的零关税只是对于借鉴加工贸易的中间产品零关税，对于其他货物是保税模式。另外，由于许多保税区的面积有限，一些设备需要在大型厂房里使用，而这些大型的厂房可能没办法全部放在保税区里，一旦在区外就要缴纳关税。“但是在海南就不存在这个问题了。”
而且，《总体方案》提出，对实行“零关税”清单管理的货物及物品，免征的不仅是进口关税，还包括进口环节增值税和消费税。
“很多情况下，进口环节增值税和消费税要比进口关税要高很多。”陈波说。
除了境外货物经一线进入自由贸易港免征进口关税，部分经“二线”进入内地的货物也可以免征进口关税。
《总体方案》提出，对鼓励类产业企业生产的不含进口料件或者含进口料海南件在海南自由贸易港加工增值超过30%（含）税法的货物，经“二线”进入内地免征进口关税，照章征收进口环节增值税、消费税。
15%企业所得税率
除了零关税，在海南自由贸易港实质经营的企业，实行企业所得税优惠税率。对符合条件的个人，实行个人所得税优惠税率。
具体而言，对注册在海南自由贸易港并实质性运营的鼓励类产业企业，减按15%征收企业所得税。对在海南自由贸易港设立的旅游业、现代服务业、高新技术产业企业，其2025年前新增境外直接投资取得的所得，免征企业所得税。对企业符合条件的资本性支出，允许在支出发生当期一次性税前扣除或加速折旧和摊销。
个人可享受到的税收与优惠，是指在海南自由贸易港工作的高端人才和紧缺人才，其个人所得税实际税税收政策负超过15%的部分，予以免征。享受这一优惠政策的高端人才和紧缺人才，实行清单管理。
“这自由贸易就有了可以和新加坡等地相比，有国际竞争力的税制安排。”胡怡建说，而且覆盖区域面积更大。
陈波认为，只有通过特殊的税收政策和产业政策，集聚了产业和借鉴人才，才能形成制度的高地。
此前上海自贸试验区临港新片区提出，对新片区内符合条件的从事集成电路、人工智能、生物医药、民用航空等关键领域核心环节生产研发的企业，自设立之日起5年内减按15%的税率征收企税法业所得税。
此外，海南自由贸易港还提出简税制，也就是要结合我国税制改革方向，探索推的进简化税制。改革税种制度，降低间接税比例，实现税种结构简单科学、税制要素充分优化、税负水平明显降低、收入归属清晰、财政收支大体均衡。
“可能对今后我国的税制改革起到示范，之后进一步扩税收政策大实施范围。也就是说，海南自由贸易港可以起到制度性先行先试的作用。”胡怡建说。
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