一、 有关税收政策
自2013年8月1日起在全国范围内实行“营改增”政策，物流企业首当其冲，从营业税改成增值税，税率从3%、5%改成11%、6%。现在税率又新近调整为9%、6%，作为物流行业的经营者，当下更为值得我们考虑的问题是：企业该用什么应对策略来保障自身的经营利润，根据对企业业务的深入分析，企业可从下面的几个主要方面做好筹划。
二、有关收入
1、详细划分各种收入类别，并分别签署合同。物流企业的主营业务包括运输配送、仓储服务、装卸服务、货运代理，其中运输服务配送适用9%的税率，仓储服务、装卸服务、货运代理属于物流辅助服务，适用6%的税率，收入核算必须区分开来，和甲方签署的合同也必须区分开来，如果没有区分开来，将从高按9%的税率缴表纳增值税。
2、部分业务适用货运代理，可签多方合同。第三方物流企业有部分业务需要委托外部资源来完成，可签署多方合同，此时第三方物流企业作为甲方的委托代理人，只收取代理物流费，适用6%的税率，外部供应商直接开发票给甲方。
3、分支机构、企业拆分。“营改增”政策中，一般纳税人的标准是年营业额5税率00万元。有分支机构的企业，可以把分支机构作为增值税的独立纳税主体，因为分支机构中大部分规模达不到一般纳税人的标准，适用小规模纳税人3%的征收率。或者把公司拆分成两家或以上家数，使各家公司的年营税率业额低于500万元，适用小规模纳税人3%的征收率。报酬此思路不适合甲方对增值税发票有要求的企业。
三、有关成本费用
1、选用一般纳税人资格的供应商。物流企业最难的是取得进项发票，所以在供应商的选择上，应尽量选择有一般纳税人资格的供应商，能取得增值税专用发票，减少税率的差距。如果供应商是小规模纳税人价格比一般纳税人优报酬惠也可，需要要求小规模纳税人到税务机关代开增值税发票即可。
2、可增加固定资产投入。第三方企业大部分是轻资产企业，“营改增”政策后，固定资产可以抵扣辅助增值税，所以应增加固定资产的投入，特别是车辆资源的投表入，不但是购入车辆时可以抵扣增值税，后续的使用(燃油的)和维护也可以抵的扣增值税。
3、选用物流企业的仓库资源。如果租用仓库，应该选择物流企业的仓库资源，以仓储服务的方式利用仓库资源，业主方给开具增值税专用发票。
4、基层作业人员的用工方式。可采用类似但又不同于派遣用工的方式，成立劳务公司，以装卸服务申请缴纳增值税，可开具增值税专用发票。
5、其他物资物流、服务采购的增值税发票。日常办公、经营中的各类物资、服务采购，如：办公耗材、周转材料、广告服务、鉴证咨询服务等，应尽量取得增值税专用发票。
四、第三方物流企业其他方面需重点关注的事项：
第一、第三方物流企业初始投资成本较大，所以应对所需资产进行筹划，能租不要买。
第二，第三方物流企业所需要人员较多，除核心团队外，以外包的形式较好。
第三、第三方物流目标客户的定位很重要，所以需进行前期大量的调研。
第四、第三方物流企业对客户结算方式决定着企业的未来持续稳定的现金流，所以如何制定价格政策，如何制定商业信用条件需在企业成立前充分进行论证。
第四，企业财务对业务的监管及支持一样重要，所以建立强大的以财务为核心的管理团队很重要。
第五、货物的损失可能是第三方企服务业不可承受之痛，所以财务保险是必须的避险措施。
第六，第三方物流企业会有大量的运输人员，购意外险，辅助为每位员工购工伤保险是企业必须付出的个人所得税成本。
第七、第三方物流企业的合同审批的各环节需整体来把握，除风险控劳务制外，主要侧重点在税收筹划劳务。
第八、第三方物流应有自营的产品的渠道，只有个人所得税这样才不会因为市场环境的一时变化而无可适从。
第九，第三方物流企业应有核心客户，但一定不能将业务局限在某一个或几个客户，那会风险很高。
第十、第三方物流企业的规模不能摊大饼，更不能小而全，借助共享的资源，整合成平台的联动机制才可能做大做强。
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