随着医改工作进入深水区，医院除了政策监管要求不断加强外，与内部运营管理有关的预算、成本、内控、绩效、院感等方面也面临巨大的挑战，内部审计作为医院内部监督的重要环节，特别是医院财务内部审计的紧迫性、必要性和重要性就突显出来，基于此我们就医院的财务内部审计内容和方法作一些探讨。
1、年度财务预决算执行情况
1.1医疗业务收入、支出、结余预算执行情况，包括预算与实际的对比，上年度与本年度同期对比，与上月环比，增减幅度，增减原因分析，结余金额，提取职工福利基金情况，结余比例、结余是否符合预期等等
1.2事业基金用于支出预算执行情况，包括人员经费预算实际完成情况，设备购置、设备修缮、大型基建工程、其他事业基金支出情况。
1.3各类专项支出预算执行情况，包括医疗专用设备购置，全科医生临床培养基地建设，大型及零星修缮预算，信息网络软硬件购建，福利基金发放，医疗风险金支出等。
1.4其他预算执行情况，包括教学经费预算，科研、继教及图书馆经费，访问学者或出国留学，医疗质量、医疗安全等各项奖励，护理质量、优质服务管理及活动经费，党建、宣传、统战工作经费，保安、消防等安全生产工作经费及其他需要列明的预算执行情况
2、政府指令性指标（经济类）完成情况
依据经济类政府指令性指标的范围及定义，核实数据的真实性、准确性，根据重要性原则，先将所有指标分为两大类：已完成、未完成，然后分别指标项列示预算与实际数据，完成比例，原因分析等。例如门诊次均费用、住院次均费用、基药使用、平均住院天数、药品收入占医药总收入的比例、卫生材料消耗占医疗收入（不含药品）的比例、检查、检验收入占医药总收入的比例等等，对于未完成的进行原因分析，总体情况进行评价。
3、财务报表审计
3.1检查会计科目，加总相关明细账户余额与总账余额比较核对二者是否一致。例如银行存款科目:至审计时点(比如2020年的年报就是31/12/2020这天，以下同)的所有银行账户账号、币种、余额清单(余额为会计账面数)以及这天所有的银行对账单，如果银行和医院之间有未达账项，还需要所有的银行余额调节表。如果现金较多，出示现金盘点单，银行借款:审计期间所有的银行借款合同，期末无余额的也要(用来测算利息用的)。如果有利息资本化的，应该找出某一个合同对应某一个在建工程。
3.2函证主要往来账户余额，选取无法函证或未取得回函的重要账户实行替代程序，确定往来结算的真实性、准确性。
3.3盘点现金，核对银行存款余额，确定货币资金的安全性及账实核对情况。
3.4清查固定资产，确定资产的管理、使用情况以及增减值情况。
3.5巡视库房，抽查清点库存药品、器材等账面存货，确定存货的保管情况以及存货资产的存在性、完整性及计价的准确性。
3.6运用统计抽样，抽查会计记录，查看原始单据，从凭证到账户
3.7审核收费系统的收入日报表、药品销售日报表、现金收入日报表，交叉核对并与相关系统核对一致。
4、其他财务相关内容的审计
4.1审核各类经济合同，对重要合同签订的招、投标及执行情况进行审查与评价。
4.2审查工程的预、决算资料，关注价格是否合适，复算工程量，确定工程支出的合理性、准确性。
4.3检查采购计划、采购合同与发票、入库单、付款支票是否对应一致。
4.4采用分析性复核程序，审查成本分摊标准的合理性、成本计算的准确性、折旧计提的正确性等。
4.5检查涉税项目，确定被审计单位是否遵守国家税收法律、法规及其他规定，是否按时、足额缴纳税款。
4.6审核费用的发生情况有没预算，审批流程和审批手续是否完整，确定其真实性、合法性、合理性。
4.7其他需要核查事项的审计程序。
通过财务内部审计的展开,可以进一步规范财务核算，降低不合理医疗费用，提高医疗服务质量，控制医疗服务成本，使群众亲身感受到加强医院管理带来的实际效果。同时基于财务审计的视角对于促进医院端正办院方向,牢记服务宗旨,树立“以病人为中心”的理念,促进医院高质量发展,发挥着重要的监督保障作用。
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