北海综合保税区前身为广西北海出口加工区，包括A区和B区。A区于2003年3月10日经中国国务院批准设立，位于北海市区西侧，批准规划面积1.454平方公里；B区于2012年3月7日经中国国务院批准设立，位于北海市铁山港区，批准规划面积1.842平方公里。
近年来，广西北海出口加工区不断优化产业结构，加速产业集聚，发展成为国内重要的电子信息产业制造基地，是中国继上海、深圳之后的第三个国家级入境再制造示范区，2018年总产值逾70亿元人民币。
为进一步提升广西北海对外开放发展水平和层次，增强北海在国家“一带一路”建设中的竞争力和吸引力，2018年2月，中国国务院批复同意广西北海出口加工区整合优化为北海综合保税区，规划面积为2.28平方公里。通过整合北海出口加工区A区、B区资源和历时8个多月的建设，2018年11月28日，北海综合保税区通过海关总署授权南宁海关牵头组成的联合验收。
作为目前中国开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全、手续最简化、通过最便捷的特殊开放区域之一，北海综合保税区具备保税加工、保税物流、保税服务的功能优势和“先行先试”的政策优势，同时具备“保税加工、保税物流、口岸”三大功能和“产品研发、加工制造、商品展示、售后维修服务、仓储物流和分销配送、国际中转与对外贸易”八项业务功能。
北海市市长蔡锦军表示，北海出口加工区整合优化为北海综合保税区，是北海乃至广西对外开放史上具有里程碑意义的一件大事。北海市将进一步加大综合保税区改革创新力度，努力把北海综合保税区打造成为北海扩大对外开放的重要窗口、承接产业转移的新战场、贸易和投资自由化便利化的先行区、开放型经济转型升级的示范区。(完)
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