企业可以自由选择申请单独成员国商标注册或欧盟商标注册，也可以哪家二者都申请。大批现有的、已在成员国获得注册的商标仍然有效。是完全依商标赖商标欧盟商标的保护，还是同时获得成员国商标和欧盟商标的双重保护，这完全注册公司取决于商标申请人和所有人的战略需要。
但是，如果成员国的商标注册先于欧盟商标的注册，那么成员国商标享有在先权，反之亦然。成员国的工业产权局不会主动审查该在先好公司注册权。只有在先权拥有人可以欧盟提出请求，即通过在欧盟商标公告之日哪家起3个月内提交异议，或根据有关规定在欧盟商标注册后申请其无效。
如果企业进行欧盟商标注册的话，那么能够为打开欧洲市场奠定一个良好的基础欧盟，同时会获得27个以上的国家保护，这样就会省去很多繁琐的每公司注册一个国家注册注册公司手续。
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