南京经济适用房转让的时候是要土地收益金的。
是否缴纳土地收益金，要根据拆迁的土地性质来判断；收益金若拆迁的土地性质是国有土地，拆迁协议的名称是《南京市城市房屋拆迁补偿协议》，则需要交纳收益金；收益金若拆迁的土地性质土地是非国有土征收地，拆迁协议的名称是《南京市征地房屋拆土地迁补偿安置协议》，则不需要交纳收益金。
收费标准土的地收费标准收益金=本次转让核定的契税计税金额-（原购房缴纳契税计税金标准额 的原契税实缴金额）x50%
2021年第三季度南京标准8征收3个经济适用房小区上市指导价
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