第一步，分清购进的货物是否属于农产品。
如果属于农产品的货物，分不同情况处理：（1）从一般纳税人购进农产品取得增值税专用发票的，凭专用发票开具的税额抵扣。（2）进口农产品取得海关进口增值税专用缴款书的，凭缴款书开具的税额抵扣。（3）从小规模纳税人（包括农业生产单位）购进农产品取得农产品销售发票的，按照财税〔2016〕36号文件附件1规定的计算公式进行进项税额抵扣。（4）从农业生产者（农民）收购农产品，自行开具农产品销售收购发票的，也按照财税〔2016〕36号文件附件1的计算公式进行进项税额抵扣。
如果不属于农产品的货物，那么，取得的增值税扣税凭证不符合法律、行政法规或者国家税务总局有关规定的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。
第二步，注意流通环节的免税农产品。
根据《财政部、国家税务总局关于免征蔬菜流通环节增值税有关问题的通知》（财税〔2011〕137号）、《财政部、国家税务总局关于免征部分鲜活肉蛋产品流通环节增值税政策的通知》（财税〔2012〕75号）两个文件的规定，从事农产品批发、零售的纳税人销售的蔬菜、部分鲜活肉蛋产品，享受免征增值税政策。从这些商贸纳税人购进蔬菜、部分鲜活肉蛋产品只能取得普通发票即农产品销售发票，但这类农产品销售发票不能作为抵扣进项税额的凭证，也就是说不能抵扣上述农产品的进项税额。除非销售方纳税人放弃免税，开具增值税专用发票或农产品销售发票，购进农产品才可抵扣进项税额。
第三步，不要误解农产品的特殊规定。
有不少纳税人，引用《国家税务总局关于农户手工编织的竹制和竹芒藤柳坯具征收增值税问题的批复》（国税函〔2005〕56号）的规定，“农民个人自产或购买竹、芒、藤、木条等，再通过手工简单编织成竹制或竹芒藤柳混合坯具的，属于自产农业初级产品”，购进这些货物时，可以抵扣进项税额。其实，他们忽视了文件中规定适用对象是“竹器企业”。也就是说，这个文件跟除竹器生产、经营企业外其他企业没有关系。因此，纳税人不要张冠李戴。
单位：广东省汕头市金平区国税局
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