针对自然人股东持有被投资企业的股权，在被投资企业的股权增值后，自然人股东在转让持有的股权后获得的溢价金额需要缴纳20%的个人所得税的情况，比如被投资企业成功挂牌新三板甚至是上市后，其股权的价值暴增几十倍，那么自然人股东转让该股权获得的巨额股权溢价，就需要缴纳高昂的个人所得税，针对这种情况，而采取的在税收洼地成立个人独资企业或合伙企业取代自然人的股东身份，持有被投资企业的股权的个人所得税税收筹划方式，从此以后不再有效，相应的方案彻底作废！
以上两种专门针对自然人持股需要缴纳高昂的个人所得税的税收筹划方案，合法合理地降低了个人所得税税负。
主要的法律依据是：财税[2000]91号《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》第七条规定“个人独资企业和合伙企业的生产经营所得可以采取核定征收方式征收个人所得税”，和国税发[2011]50号《关于切实加强高收入者个人所得税征管的通知》的规定“对个人独资企业和合伙企业从事股权（票）交易取得的所得，全部纳入生产经营所得，依法征收个人所得税。”
但是，就在2021年年底的最后一天，2021年12月30日，财政部和国家税务总局联合发布了公告2021年第41号《关于权益性投资经营所得个人所得税征收管理的公告》，使得前述这种个人所得税税收筹划的操作彻底无效，方案彻底作废！
财政部税务总局公告2021年第41号第一条明确规定：持有股权、股票、合伙企业财产份额等权益性投资的个人独资企业、合伙企业，(不再适用核定征收的方式），而一律适用查账征收方式计征个人所得税，且自2022年1月1日起施行。
也就是，自此以后，凡是个人独资企业或合伙企业持有被投资企业的股权，在转让持有的被投资企业的股权时，就股权增值而产生的溢价金额，一律按照5%~35%的税率计算缴纳个人所得税，不再按照0.5%~3.5%的税收洼地的核定征收税率缴纳个人所得税。如此，在2021年最后一天，财政部和国家税务总局联手又堵住了一个个人所得税的漏洞！
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