3.初始化。纳税人务必在申报前进行初始化更新，才可以进行申报表的填写和申报操作。对于可以联网的纳税人，当首次登录金三版申报软件后，系统将提醒纳税人联网进行初始化更新，纳税人无需下载初始化文件；若纳税人电脑不能联网，则需要登录网上申报系统下载最新初始化文件，并在金三版申报软件中进行初始化更新操作，导入企业的初始化文件；介质申报纳税人和新开通电子申报纳税人，必须由办税服务厅窗口人员为纳税人生成注册文件和初始化文件。
4.数据查询。金三版申报软件只能从原申报软件中导入注册文件信息和企业基本信息，不能迁移原有申报表数据，因此建议纳税人在安装金三版申报软件后，不要卸载原申报软件，以便于历史数据的查询和历史申报表的打印等。
5.软件兼容。原使用个体简版申报软件的纳税人可以自行选择使用个体移动终端(APP)申报软件、基础版申报软件或者商业版申报软件进行纳税申报。
二、升级后的新版申报平台软件，整合了原有电子申报平台和税收数据采集申报系统的功能，纳税人一次登录即可使用原有两款软件的功能。使用税收数据采集申报系统的纳税人可在新版申报平台软件安装完毕后，通过数据备份还原的功能将原有税收数据采集申报系统的备份数据导入即可使用。
三、使用机打普通发票系统的纳税人需要进行软件升级，升级方式包括在线升级和下载升级包离线升级两种方式，升级后软件即可正常开票。在系统升级时，纳税人以前的发票数据都将保留，未开具的空白发票在升级后仍可正常开具，升级前未上传的开票数据也可正常上传。
“网上办理涉税业务系统”等网页版涉税软件无变化，欢迎广大纳税人继续使用。
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