《办法》提出，农民工工资保证金（以下简称“工资保证金”）可以用银行类金融机构出具的银行保函替代，有条件的地区可以探索引入工程担保公司保函或工程保证保险。施工总承包单位应当自工程项目取得施工许可证（开工报告批复）或签订施工合同之日起20个工作日内，持营业执照副本、与建设单位签订的施工合同到经办银行开立工资保证金专门账户，按照属地人力资源社会保障行政部门核定的数额存储工资保证金。工资保证金按照工程施工合同额（或年度合同额）的2%存储。单个工程施工合同额较高的，工资保证金存储金额不超过500万元。
《办法》规定了降低存储比例或免于存储的情形：施工总承包单位在同一工资保证金管理地区有2个以上在建工程，除第一个在建工程外，其新增工程项目工资保证金存储比例降低50%；单个工程施工合同额低于300万元，且该工程的施工总承包单位在签订施工合同前1年内承建的工程未发生工资拖欠的，免除该工程存储工资保证金；施工总承包单位存储工资保证金或提交银行保函后，在工资保证金管理地区承建工程项目连续2年未发生工资拖欠的，其新增工程项目工资保证金存储比例降低50%；施工总承包单位存储工资保证金或提交银行保函后，在工资保证金管理地区承建工程项目连续3年未发生工资拖欠，且按要求落实用工实名制管理、农民工工资专用账户和施工总承包单位代发工资制度的，其新增工程项目免于存储工资保证金。
《办法》还设置了惩处措施：施工总承包单位存储工资保证金或提交银行保函前2年内在工资保证金管理地区承建工程项目发生工资拖欠的，其工资保证金存储比例提高50%；施工总承包单位存储工资保证金或提交银行保函前2年内因拖欠农民工工资被纳入“严重失信主体名单”的，其工资保证金存储比例提高100%。以上提高工资保证金存储比例后的存储金额不受存储上限500万元的限制。
《办法》自3月10日起实施。《办法》施行前，已按原有工资保证金政策存储的工资保证金或银行保函等继续有效，其日常管理、动用和返还等按照原有规定执行；《办法》施行后，新开工工程和尚未存储工资保证金的在建工程按照本《办法》执行。
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