依法科学制定免罚清单。行政处罚法第33条明确限定了不予处罚的情形，第34条授权可以制定裁量基准。制定的法定条件包括：一是相关行政机关有权制定裁量基准；二是制定免罚清单应限定在法定情形内；三是依照法定程序制定，且向社会公开。现行多数清单主要以行政规范性文件形式予以制定实施，有的冗长，与实际情况脱节，有的简单列举，更有甚者直接取消了裁量权。由此，强调科学制定就非常重要，即要基于行政裁量基准运转的规律予以制定：免罚基准规定内容应合法合理、公平公正，免罚清单应结合地方实际。一些直接涉及安全底线、环保红线、食品安全、疫情防控等严重危害人民群众生命财产安全、市场公平竞争秩序等领域违法行为不适合免罚。此外，免罚清单应包括升格条款，免罚后，后续逾期不改正或经教育后再犯的，原裁量基准可逐级升格为一般、严重、特别严重等情形，予以相应处罚。
综合研究免罚清单裁量基准因素。清单将裁量事项具体化、标准化、精细化，可以给行政执法机关和行政执法人员明确的指引，有学者将这一技术称为“使自由裁量结构化”，并强调要避免格式化。今天，行政机关越来越趋于用技术手段解决问题，如对处罚金额细化、量化，运用计算机技术将标准和流程全部在网络上进行固化，这也是免罚清单的必经之路。在形成固化标准之前，应当综合考虑违法事实、性质、情节、社会危害程度等因素，当事人是否有主观故意及主观恶性的大小；涉案财物或违法所得的多少；违法行为持续时间的长短；违法行为的规模或涉及的区域范围的大小；当事人是否多次违法；违法行为的手段是否恶劣；违法行为的危害后果、社会影响程度。有些案件还需结合每一类违法行为的特点，予以补充完善裁量因素，例如涉及排污处罚中，要考虑企业规模、排污单位许可类别、项目位置等；市场监管处罚中要考虑市场主体的性质、企业的发展、营商环境等等。
超前考虑免罚清单智能化辅助。行政处罚属于高权行为，直接关系到人民群众利益，也给执法者带来了挑战。近年来，行政机关多采用行政处罚裁量的辅助系统，且已推广到城市管理、海关、交通运输以及税收管理等领域，并朝着精细化、精准化、全局化以及普遍化方向发展。裁量的自动化及智能化出现，有利于节约行政成本，提高效率，精准处罚。不过，目前的辅助系统均定位为辅助性、可利用性，基本界定于半自动化。基于未来考虑，在科学依法制定免罚清单的基础上，也需要同时考虑到机器参与的指标设计，形成可裁量的标准及数据，使机器可以根据建模程序进行自动裁量。这种自动裁量除合法性仍需研究外，还应超前研究免罚清单的裁量基准的程序设计，根据构成要件和法律后果，形成对应行政处罚裁量程序，实现机器裁决与人工裁量的一致性、匹配性，同时，对机器智能化的发展也应形成一定的预设及限制，包括事后产生争议的话，司法审查的介入，及时纠正半自动或全自动裁量的偏差。
