2020年7月2日，据深圳市人力资源和社会保障局网站，深圳发布《关于落实粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》和《深圳市境外高端人才和紧缺人才2019年纳税年度个人所得税财政补贴申报指南》。
2019年6月18日，广东省财政厅、国家税务总局广东省税务局印发了《关于贯彻落实粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》（粤财税〔2019〕2号），贯彻落实财政部、税务总局2019年3月14日印发的《关于粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》（财税〔2019〕31号）。该文件指出，在中央政策的基础上，进一步细化明确差额补贴的标准和范围、人才认定的框架范围和原则意见等要求，并返还充分考虑珠三角九市的实际需要，由各市根据当地实施制定高端人才和紧缺人才的具体认定标准和操作办法，赋予各市充分的自主权。
这一政策的出台，使得大湾区工作的境外人才实际税负水平明显降低，对大湾区广聚英才将起到积极的引导和推动作用。
2020年3月17日，深圳根据《财政部税务总局关于粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》（财税〔2019〕31号）要求，制定《关于落实粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》。
2020年6月30日，深圳出台《深圳市境外高端人才和紧缺人才2019年纳税年度个人所得税财政补贴申报指南》。
深圳市人力资源和社会保障局深圳市科技创新委员会深圳市财政局国家税务总局深圳市税务局关于落实粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知
各区人民政府，大鹏新区、深汕特别合作区管委会，前海管理局，各有关单位：
为支持粤港澳大湾区建设，根据《财政部税务总局关于粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通知》（财税〔2019〕31号）要求，经市政府同意，结合深圳实际，现就有关事项通知如下：
一、对在深圳工作的境外高端人才和紧缺人才，按内地与香港个人退税所得税税负差返还额给予补贴，该补贴免征个人所得税。在纳税年度内，申报人已纳税额减去测算税额，即为申报人可申请当年度个人所得税补贴。
二、本通知所称的已纳税额，是指下列所得按照《中华人民共和国个人所得税所得税法》规定缴纳的个人所得税额：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）入选人才工程或人才项目获得的补贴性所得。
三、本通知所称的测算税额，是指在纳税年度内申报人的个人所得按照香港的税法测算的应纳税额。申报人政策文件20深圳市19年纳税年度补贴税额按标准税率法测算，第一年度后可选择标准税率法或累进税率法测算。
（一）标准税率法深圳。测算税额＝申报人应纳税所得额15％。
（个人所得税二）累进税率法。测算税额为申报人以原始收入（不包括符合香港税法所规定的免税条件、雇员以非现金形式或实报实销的形式获得的福利），按照香港税法计算的应纳税额。
四、补贴根据个人所得项目，按政策文件照分项计算（综合所得进行综合计算）、合并补贴的方式进行计算。
五、对境外高端人才和紧缺人才，按照自愿申报、科学客观的原则进行认定。
六、境外高端人才和紧缺人才是指深圳，香港、澳门永久性居民，取得香港入境计划（优才、专业人士及企业家）的香港居民，赴港澳定居的内地居民（已注销内地户籍），台湾地区居民，已纳税所得额达到限额的外国国籍人士，取得国外长期居留权的回国留学人员和海外华侨等，在我市用人单位个人工作并在深圳依法纳税，遵守法律法规、科研伦理和科研诚信，同时符合下列条件之一：
（一）国家、省、市重大人才工程入选者、取得广东省“人才优粤卡”、外国人来华工作许可证（A类、B类）或外国高所得税端人才确认函的人才，以及国家、省、市认定的其他境外高层次人才。
（二）国家级、省级或市级重大创新平台的科研团队成员和中层以上管理人才。
（三）高等院校、科研机构、医院等相关机构中的科研技术团队成员、中层以上管理人员或承担市级以上在研重大纵向课题的团队成员，以及市级以上重点学科、重点专科等带头人。
（四）经认定的总部企业、世界五百强企业及其分支机构和我市高新技术企业、大型骨干企业、上市企业以及入库培育企业、高成长性科技创新型中小企业的中层以上管理人员、科研团队成员、技术技能骨干和优秀青年人才。
（五）在我市重点发展产业、重点领域就业创业的中层以上管理人员、科研团队成员、技术技能骨干和优秀青年人才。
七、个人所得税补贴资金，由市区财政按照市区共享税分成比例负担。各区（含新区、深汕合作区）、前海合作区负责所属辖区高端人才和紧缺人才个人所得税补贴的申请受理、审核、发放工作。深圳市申报人不重复享受本市其他与个人所得税相关的个人人才优惠政策。
八、申报人存在弄虚作假行为的，取消其申请资格，五年内不再受理该申报人个人所得税补贴申请；对已经取得个人所得税补贴的，由补贴发放部门对补贴资金及利息（以补贴发放日为起始日期、以补贴退回日前一日为截止日期，按照中国人民银行活期存款利率计算利息，如遇利率调整，则分段计算）予以追缴；涉嫌犯罪的，移交司法机关依法追究刑事责任。
九、每年度申报指南由市人力资源保障局会同市科技退税创新委（市外专局）、市财政局发布。本通知自2020年3月27日至2023年12月31日止施行。2019年1月1日起符合本通知规定的申报人，可按照本通知规定申请补贴。
特此通知。
深圳市人力资源和社会保障局
深圳市科技创新委员会
深圳市财政局
国家税个人所得税务总局深圳市税务局
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