近年来，上市药企普遍加大研发投入。从整体情况看，115家药企2020年研发投入金额共计288.65亿元，较2019年的241.04亿元增长近两成。2016年至2018年，上述115家公司的研发投入总额分别为119.36亿元、150.58亿元和210.32亿元，整体投入金额逐年攀升。个股层面，有80家公司2020年研发投入金额较上年增加，其中，英科医疗增幅最大，该公司2020年研发投入金额为2.93亿元，较2019年的0.68亿元增加了三倍多。一心堂、柳药股份、康希诺、圣湘生物、特宝生物2020年研发投入金额增幅分别为2.52倍、2.15倍、1.72倍、1.12倍和1.03倍。
从研发投入占比看，创新药企尤其是生物制药企业普遍较高，中医药企业相对偏低。其中，百奥泰、前沿生物和君实生物等三家未盈利公司研发投入占比暂居前三位，分别为304.15%、297.05%和112.72%。此外，三生国健和微芯生物研发投入占比超50%。中医药行业中，沃华医药、东阿阿胶和华润三九去年研发投入占比相对较高，分别为4.64%、4.51%和4.26%，同仁堂和白云山分别为2.01%和1.00%。而目前总市值超1500亿元的云南白药研发投入占比仅为0.55%。
在研发投入持续攀升的背后，是近年来我国出台了一系列政策鼓励药企创新。其中，集采政策、一致性评价工作的推进，都在倒逼药企朝创新方向转型。国泰君安医药团队认为，中国医药创新新时代已经到来，头部企业开始进行原始创新。不过该机构也提醒，创新药企面临技术路线和产品研发存在不确定性、竞争恶化、融资不及预期等风险。一方面，创新药公司部分技术路线或产品处于临床验证早期阶段，新药研发存在较大不确定性。另一方面，国内部分新兴技术路线产品上市后可能销售不达预期。此外，创新药公司不断提高研发投入，而短期内盈利能力有限，可能面临融资不及预期的财务风险。
